卫生部2010年1月2日通报指出，截至2009年12月31日，全国31个省份累计报告甲型H1N1流感确诊病例12万余例，已治愈11万例，死亡648例。

　　2009年12月份，全国流感哨点监测结果显示，流感病例占流感样病例的比例为42.4%,比11月份的52.2%明显下降；甲型H1N1流感病例占流感病例的比例为85.9%，比11月份的89.3%有所下降。

　　通报指出，2009年12月份我国内地疫情有以下特点：

　　一是疫情波及范围进一步扩大。除海南外，所有省份均报告了死亡病例。北京、上海等一些大城市学校暴发疫情明显下降，但疫情继续向农村蔓延、社区扩散。

　　二是甲型H1N1流感每周报告新增确诊病例数、流感样病例占门急诊病例的比例均呈下降趋势。

　　三是重症和死亡病例数显著增加。数据分析提示，慢性基础病患者、肥胖人群和妊娠妇女易成为甲型H1N1流感重症、危重症患者。

　　四是病毒基因测序未发现明显变异。12月份，网络实验室共对75株甲型H1N1流感病毒进行分离测序，未发现耐药性毒株；发现从4例轻症患者分离出的4株病毒HA基因的第222位氨基酸出现突变，研究证实，4例病例无流行病学关联，病毒没有出现持续传播，病毒毒力、致病力和免疫原性未发生明显变化。

　　五是全人群的整体免疫保护水平仍较低，有效的免疫保护屏障尚未建立。综合局部地区人群感染水平调查结果和甲型H1N1流感疫苗接种情况，专家推算，我国内地约15%的人口具有抵抗甲型H1N1流感病毒感染的免疫保护力。

　　据统计，截至2009年12月31日，全国累计完成甲流疫苗接种4991万人。疫苗接种异常反应监测显示，疑似预防接种异常反应报告发生率约为12.4/10万，严重异常反应报告发生率约为0.1/10万；在12月份疫苗接种人群中出现2人死亡，经证实均与疫苗接种无关。我国疫苗接种不良反应发生率未超过国内外甲型H1N1流感疫苗临床试验结果，与世界卫生组织通报的各国数据基本一致。

　　专家分析指出，近期甲型H1N1流感病毒出现明显变异的可能性仍然较小。我国流感监测网络显示，境内流感样疾病活动水平近期下降，但考虑全人群免疫保护水平有限，有效免疫保护屏障尚未形成，随着疫情向社区和农村扩散，预计在未来一段时间内，病毒传播将依然活跃，局部地区出现暴发疫情的风险仍然存在，每周新增重症和死亡病例数仍将维持在较高水平。农村地区，尤其是农村学校将是下一阶段防控重点；孕妇、基础性疾病患者、农村地区的学生仍是当前重点防控人群。